Селекционная работа с гуппи основана на отборе, то есть отбраковке рыб, заведомо непригодных для разведения, подборе лучших производителей из числа оставшихся после отбора и гибридизации, после чего снова проводятся отбор, подбор и так далее. При разведении вуалевых гуппи, принадлежащих к одной линии, уже через несколько поколений происходит их вырождение, то есть развал хвоста уменьшается, вуаль становится непрочной, укорачивается или становится вилочной, окраска тела блекнет или изменяется в сторону окраски предков, на хвосте появляются лишенные окраски участки, снижается жизнеспособность, увеличивается предрасположение к заболеваниям, уменьшается плодовитость и учащаются случаи бесплодия. Происходит это в результате длительного инбридинга, при котором из - за замкнутости наступает гомозиготность (Зигота — диплоидная клетка, то есть оплодотворенная яйцеклетка (икринка), образованная в результате слияния мужской (сперматозоид) и женской (яйцеклетка) гамет. В зиготе образуется диплоидное ядро, в котором один гаплоидный набор получен от матери, второй — от отца. Гомозигота — диплоидная клетка, возникшая от слияния гамет, идентичных по качеству, количеству и структурному расположению всех или части генов. Гомозигота дает генетически однородные гаметы. Ее противоположностью является гетерозигота, при которой наступает расщепление в потомстве, так как она дает генетически различные гаметы. Инбридинг разрушает гетерозиготность и ведет к появлению гомозигот, почему встреча «вредных» генов более вероятна.) по генам, снижающим жизнеспособность организма. У круглохвостых форм гуппи отрицательное действие даже длительного инбридинга не сказывается столь отрицательно, так как за многие годы их существования произошла отработка и стабилизация их конституционных особенностей. Наблюдается лишь уменьшение размеров и плодовитости, что можно объяснить малыми размерами аквариумов, высокой плотностью посадки, частым или постоянным применением сухого корма. У вуалевых гуппи еще не произошла отработка признаков, и, чтобы поддерживать разновидность этих рыб на должном уровне, необходимо время от времени (обычно 1 раз в 2...3 года в зависимости от разновидности) освежать кровь, скрещивая их с производителями такой же разновидности, но взятыми из другого аквариума, и если они не имеют общих предков, то есть не относятся к одной и той же линии, но целесообразнее, особенно если разновидность уникальна, держать 2...3 параллельные линии, скрещивая их поочередно.
Создавая новую разновидность, необходимо помнить, что в ядрах клеток гуппи содержится диплоидный набор из 46 хромосом (половина от матери, половина от отца), причем из них 22 пары гомологичных хромосом являются аутосомами, или обычными, а одна пара, отличающаяся от них, — половыми (определяет будущий пол). У самок половые хромосомы одинаковые — я: и х, а у самцов — разные, одна х, другая у, то есть самки гуппи гомогаметны, а самцы гетерогаметны. При делении зиготы хромосомы расходятся поровну и в каждой из двух гамет будет по гаплоидному (одному) набору хромосом, состоящему из 22 аутосом и одной половой хромосомы. Поэтому у самки в каждой неоплодотворенной яйцеклетке содержится по одной х - хромосоме, а у самца 50% сперматозоидов имеют x - хромосомы и 50% — у - хромосомы. В результате оплодотворения вновь образуются зиготы с диплоидным набором хромосом. Яйцеклетка, оплодотворенная сперматозоидом с у - хромосомой, превратится в самца, с х - хромосомой — в самку. Поэтому в нормальных условиях соотношение полов должно быть 1:1. Гены окраски передаются у гуппи от отца к сыновьям через у - хромосому, но некоторые могут переходить из у - в х - хромосому и обратно в процессе перекреста (кроссинговера) — взаимного обмена генами или участками гомологичных хромосом, происходящего в результате разрыва и соединения в новом порядке, что приводит к рекомбинации сцепленных генов и в итоге вызывает изменчивость признаков.
Поколение селекции линия А Испытание помесей на гетерозис, диаллельные скрещивания линия В
Чтобы закрепить интересующий признак, который может оказаться рецессивным, на первых порах целесообразно использовать возвратное скрещивание: лучших виргинных гибридных самок первого поколения скрестить с отцом. В этом случае потомков с рецессивными признаками будет больше, чем при скрещивании между собой гибридов первого поколения.
К тому же такое скрещивание дает возможность выявить нежелательные рецессивные гены. Затем с этим же самцом скрещивают виргинных самок второго поколения. Чтобы в дальнейшем предотвратить вредные последствия длительного инбридинга, при наличии 2...3 однотипных самцов нужно держать 2...3 параллельные линии. Если же такой самец один, то эти линии нужно закладывать, подбирая ему самок сходной разновидности, совершенствуя параллельные линии с помощью отбора, подбора и инбридинга разной степени родства. Занимаясь селекцией гуппи, от каждой линии необходимо иметь достаточное количество самок разных пометов для сохранения генофонда.
Для выведения новой породы (породной группы, разновидности) у рыб нужно проводить 4 типа скрещиваний. Воспроизводительное скрещивание применяют, когда хотят сочетать многие признаки от обеих скрещиваемых пород, вводное — когда к признакам одной (основной, улучшаемой) хотят добавить один или немного признаков другой (улучшающей). С вводным скрещиванием сходно поглотительное, когда после исходного скрещивания двух пород проводится серия возвратных скрещиваний и при этом гибриды скрещиваются с особями улучшающей породы. При альтернативном скрещивании, которое в наибольшей степени позволяет избегать инбридинга, гибридов поочередно скрещивают с особями двух пород, но через 3...4 поколения для закрепления признаков новой породы его заменяют воспроизводительным скрещиванием. Три первых типа сочетаются между собой.
Некоторые доминантные признаки установлены твердо. Так, карликовость самцов доминирует над нормальным размером, а последний, в свою очередь, над гигантизмом; серая окраска
Тела – над золотистой; округлая форма хвоста – над любой другой; темная окраска глаз – над красной (альбиносы).

А. Полонский